Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TesP47226 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TesP47226 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TesP47226 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TesP47226 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TesP47226 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TesP47226 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TesP47226 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TesP47226 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TesP47226 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TesP47226 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TesP47226 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms