Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms