Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms