Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hist1h1bP43276 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms