Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv1P41164 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv1P41164 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms