Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbP41155 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtbP41155 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtbP41155 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtbP41155 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms