Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd9P40240 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms