Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ThpoP40226 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ThpoP40226 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ThpoP40226 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms