Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf2P39429 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf2P39429 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms