Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk2P38575 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk2P38575 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms