Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn1P35821 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms