Protein–RNA interactions for Protein: P35802

Gpm6a, Neuronal membrane glycoprotein M6-a, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpm6aP35802 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpm6aP35802 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpm6aP35802 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms