Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms