Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpardP35396 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpardP35396 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpardP35396 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PpardP35396 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpardP35396 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpardP35396 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpardP35396 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpardP35396 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpardP35396 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpardP35396 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpardP35396 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpardP35396 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpardP35396 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpardP35396 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpardP35396 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms