Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab6aP35279 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab6aP35279 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms