Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms