Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd1P33215 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms