Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsx2P31316 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gsx2P31316 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gsx2P31316 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx2P31316 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms