Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms