Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd28P31041 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms