Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sstr1P30873 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sstr1P30873 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sstr1P30873 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sstr1P30873 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sstr1P30873 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sstr1P30873 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sstr1P30873 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sstr1P30873 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr1P30873 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sstr1P30873 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr1P30873 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr1P30873 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms