Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VtnP29788 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VtnP29788 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VtnP29788 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VtnP29788 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VtnP29788 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VtnP29788 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VtnP29788 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VtnP29788 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VtnP29788 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VtnP29788 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VtnP29788 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms