Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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