Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms