Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms