Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb1P28230 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms