Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lef1P27782 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms