Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afxP27661 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afxP27661 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afxP27661 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afxP27661 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms