Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmbsP22907 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmbsP22907 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmbsP22907 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmbsP22907 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmbsP22907 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmbsP22907 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms