Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KitlgP20826 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KitlgP20826 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KitlgP20826 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms