Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms