Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms