Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka1P18653 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 386.8 ms