Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18528 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18528 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18528 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18528 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18528 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18528 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
P18528 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18528 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18528 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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