Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms