Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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