Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnaP17918 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnaP17918 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnaP17918 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnaP17918 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms