Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptan1P16546 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms