Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms