Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkceP16054 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms