Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dnmt1P13864 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms