Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd2P13011 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms