Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb1P12658 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb1P12658 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms