Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms