Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms