Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms