Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms