Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms