Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms