Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtaP09225 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtaP09225 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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LtaP09225 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtaP09225 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtaP09225 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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